Սերինային պրոթեզերոնի կատալիտիկ մեխանիզմի հիմնական դերակատարը կատալիտիկ եռյակն է կատալիտիկ եռյակը Կատալիտիկ եռյակը երեք համակարգված ամինաթթուների հավաքածու է, որը կարելի է գտնել ակտիվում: որոշ ֆերմենտների տեղամաս: Կատալիզատոր եռյակներն առավել հաճախ հանդիպում են հիդրոլազների և տրանսֆերազների ֆերմենտներում (օրինակ՝ պրոթեզերոններ, ամիդազներ, էսթերազներ, ացիլազներ, լիպազներ և β-լակտամազներ): https://en.wikipedia.org › wiki › Catalytic_triad
Կատալիտիկ եռյակ - Վիքիպեդիա
. … Սերինն ունի -OH խումբ, որն ի վիճակի է հանդես գալ որպես նուկլեոֆիլ՝ հարձակվելով ենթաշերտի կտրող պեպտիդային կապի կարբոնիլ ածխածնի վրա:
Ինչպե՞ս են գործում սերին պրոթեզերոնի ինհիբիտորները:
Սերինի պրոթեզերոնի ինհիբիտորները կամ սերպինները ներառում են սպիտակուցների ընտանիք, որոնք հակազդում են սերինային պրոտեազների ակտիվությանը: … Այս մեխանիզմում սերպինը ներկայացնում է սուբստրատի նմանակող պեպտիդային հաջորդականություն՝ ռեակտիվ կենտրոնական օղակը դեպի իր թիրախ սերին պրոթեզերոն:
Ի՞նչ դեր է խաղում սերինային պրոթեզերոնի ռեակցիայի մեխանիզմում լիցքավորման ռելեային համակարգը:
Asp102-ի դերը սերինային պրոթեզերոնի կատալիտիկ ռելե համակարգում ուսումնասիրվում է տեսականորեն հաշվարկելով մեկ պրոտոն-փոխանցման ռեակցիայի ազատ էներգիայի պրոֆիլները Asn102 մուտանտ տրիփսինի և Վայրի տիպի տրիպսինի փոխհամաձայնեցված կրկնակի պրոտոն-փոխանցման ռեակցիա (այսպես կոչված՝ լիցք-ռելեի մեխանիզմ):
Հետևյալներից ո՞ր մեկն է սերին պրոթեզերոնի օրինակ:
Chymotrypsin: > Օգտագործվում է որպես սերին պրոթեզերոնի օրինակ, քանի որ դրա կառուցվածքը և մեխանիզմը լավ հասկանալի են:
Որո՞նք են սերինային պրոթեզերոնի կոչման պատճառները:
Նրանք կոչվում են սերինային պրոթեզերոն երկու պատճառով՝
- Նրանք հիդրոլիզացնում են սպիտակուցները։
- Ակտիվ տեղում ունեն էական Ser մնացորդ, որը կարևոր է կատալիզացման համար: Իրականում այս Ser-ը շատ ավելի ռեակտիվ է, քան մյուս սերինները սպիտակուցի մեջ:
