Մոլեկուլային կենսաբանության մեջ STRING-ը (Փնտրման գործիք փոխազդող գեների/սպիտակուցների որոնման համար) կենսաբանական տվյալների բազա է և սպիտակուց-սպիտակուցի հայտնի և կանխատեսված փոխազդեցությունների վեբ ռեսուրս: … 11b վերջին տարբերակը պարունակում է տեղեկատվություն ավելի քան 5000 օրգանիզմների մոտ 24,5 միլիոն սպիտակուցների մասին:
Ո՞րն է STRING տվյալների բազայի նպատակը:
STRING տվյալների բազան նպատակ ունի հավաքել և ինտեգրել այս տեղեկատվությունը՝ համախմբելով հայտնի և կանխատեսված սպիտակուցի–սպիտակուցային ասոցիացիայի տվյալները մեծ թվով օրգանիզմների համար:
Ի՞նչ է STRING միավորը:
STRING-ում յուրաքանչյուր սպիտակուց-սպիտակուց փոխազդեցություն նշվում է մեկ կամ մի քանի «նշաններով»: Կարևոր է, որ այս միավորները չեն ցույց տալիս փոխազդեցության ուժը կամ առանձնահատկությունը: Փոխարենը, դրանք վստահության ցուցիչներ են, այսինքն՝ որքանով է հավանական STRING-ը, որ փոխազդեցությունը ճշմարիտ է՝ հաշվի առնելով առկա ապացույցները:
Ինչու են սպիտակուցները փոխազդում:
Սպիտակուց-սպիտակուց փոխազդեցությունները (PPIs) բարձր սպեցիֆիկության ֆիզիկական շփումներ են, որոնք հաստատվել եներկու կամ ավելի սպիտակուցի մոլեկուլների միջև՝ կենսաքիմիական իրադարձությունների արդյունքում, որոնք ուղեկցվում են էլեկտրաստատիկ ուժերով, ջրածնով: կապը և հիդրոֆոբ ազդեցությունը:
Ի՞նչ է ֆունկցիոնալ ասոցիացիան:
սահմանում. Կենսաբանական սուբյեկտների միջև երկուական հարաբերություն երբ նրանցից մեկը մոդուլացնում է մյուսին մյուսի ֆունկցիայի, արտահայտման, դեգրադացիայի կամ կայունության և հարաբերությունների առումովԳործընկերների միջև հնարավոր չէ պարզել որպես ուղղակի, ուստի միջանկյալ քայլերը անուղղակիորեն առկա են:
