Ի հակադրություն, էուկարիոտ ԴՆԹ-ի լիգաների մեծ մասը, արխեալ և բակտերիոֆագ ֆերմենտների հետ միասին, ընկնում են երկրորդ ենթաընտանիքին. այս ֆերմենտները օգտագործում են ATP որպես կոֆակտոր:
Լիգազները պահանջում են ATP?
Սովորաբար օգտագործվում են երկու ԴՆԹ լիգաներ: … T4 լիգազան պահանջում է ATP , մինչդեռ E. coli լիգազան պահանջում է NAD+ (նիկոտինամիդ ադենին դինուկլեոտիդը կոֆերմենտ է, որը բաղկացած է 2 nt-ից, որոնք միացված են իրենց ֆոսֆատ խմբերի միջոցով:): Երկուսն էլ կատալիզացնում են 5'-ֆոսֆատ և 3'-OH խմբերի միացումը՝ ձևավորելով ֆոսֆոդիեսթեր կապ։
Ինչու են լիգաներին անհրաժեշտ ATP:
ԴՆԹ-ի կապակցման ռեակցիայի երկու փուլերը
ԴՆԹ-ի կապակցման ռեակցիան ինքնին ունի երկու հիմնական փուլ: Նախ ԴՆԹ-ի ծայրերը պետք է պատահաբար բախվեն և այնքան երկար մնան միասին, որպեսզի լիգազան միանա դրանց: … Որպեսզի ֆերմենտը կարողանա հետագա ռեակցիաներ իրականացնել, AMP-ն ֆերմենտի ակտիվ վայրում պետք է համալրվի ATP-ով:
Ի՞նչ գործառույթ ունեն լիգազները:
ԴՆԹ-ի լիգաները էական դեր են խաղում գենոմային ամբողջականության պահպանման գործում՝ միացնելով ԴՆԹ-ի ֆոսֆոդիստերային ողնաշարի ճեղքերը, որոնք առաջանում են վերարտադրության և վերահամակցման ընթացքում և որպես ԴՆԹ-ի վնասման և դրա հետևանք: վերանորոգում. Մարդու երեք գեները՝ LIG1, LIG3 և LIG4, կոդավորում են ATP-ից կախված ԴՆԹ-ի լիգաները:
Ի՞նչ են լիգաները, դրանք ակտիվ, թե պասիվ են գործում:
ԴՆԹ-ի լիգազան ակտիվ է ԴՆԹ-ի վերարտադրության, վերականգնման և ռեկոմբինացիայի գործընթացում: Այն լայնորեն կիրառվում է միաշղթաների վերանորոգման մեջխախտում է կենդանի օրգանիզմների դուպլեքս ԴՆԹ-ն՝ օգտագործելով կրկնակի պարույրի լրացուցիչ շղթան որպես ձևանմուշ, մինչդեռ որոշ ձևեր կարող են հատուկ շտկել երկշղթայի վնասները:
