Ագարոզայի գելերը օգտագործվում են ԴՆԹ-ի հետ՝ պայմանավորված բիոմոլեկուլների ավելի մեծ չափսերով (ԴՆԹ-ի բեկորները հաճախ հազարավոր կԴա են): Սպիտակուցային գելերի համար պոլիակրիլամիդը տալիս է լավ լուծաչափ, քանի որ շատ ավելի փոքր չափսը (50 կԴա բնորոշ է) ավելի հարմար է գելի ավելի նեղ միջմոլեկուլային բացերի համար:
Ո՞րն է տարբերությունը ագարոզայի գելային էլեկտրոֆորեզի և պոլիակրիլամիդ գելային էլեկտրոֆորեզի միջև:
Ագարոզայի և պոլիակրիլամիդի հիմնական տարբերությունն այն է, որ ագարոզն օգտագործվում է ագարոզայի գելի էլեկտրոֆորեզում (AGE) հիմնականում ԴՆԹ-ի բաժանման համար, մինչդեռ պոլիակրիլամիդն օգտագործվում է պոլիակրիլամիդ գելում: էլեկտրոֆորեզ (PAGE) հիմնականում սպիտակուցների տարանջատման համար։
Ինչու՞ են պոլիակրիլամիդային գելերն ավելի լավ, քան ագարոզայի գելը:
Պոլիակրիլամիդ գելերն ունեն հետևյալ երեք հիմնական առավելությունները ագարոզայի գելերի նկատմամբ. (1) Նրանց լուծող ուժն այնքան մեծ է, որ նրանք կարող են առանձնացնել ԴՆԹ-ի մոլեկուլները, որոնց երկարությունները տարբերվում են 0,1%-ով (այսինքն՝ 1 bp 1000 bp-ում):): (2) Նրանք կարող են շատ ավելի մեծ քանակությամբ ԴՆԹ տեղավորել, քան ագարոզայի գելերը:
Ինչու՞ է սպիտակուցները բնութագրելիս ագարոզայի փոխարեն օգտագործվում պոլիակրիլամիդ:
Պոլիակրիլամիդը և ագարոզը երկու օժանդակ մատրիցներ են, որոնք սովորաբար օգտագործվում են էլեկտրոֆորեզում: … Ագարոզան ունի ծակոտիների մեծ չափ և հարմար է նուկլեինաթթուների և մեծ սպիտակուցային համալիրների բաժանման համար: Պոլիակրիլամիդն ունի ավելի փոքր ծակոտի չափ և իդեալական էբաժանում է սպիտակուցների և ավելի փոքր նուկլեինաթթուների մեծամասնությունը:
Ինչու է օգտագործվում պոլիակրիլամիդ գելը:
Պոլիակրիլամիդ գելային էլեկտրոֆորեզը (PAGE) սովորաբար օգտագործվում է սպիտակուցի վերլուծության համար և կարող է օգտագործվել նաև 100 bp-ից փոքր նուկլեինաթթվի բեկորները առանձնացնելու համար: Նուկլեինաթթուները սովորաբար վերլուծվում են շարունակական բուֆերային համակարգի միջոցով, որտեղ կա մշտական բուֆերային բաղադրություն, pH և ծակոտիների չափս ամբողջ գելում:
