Պեպտիդային կապերն ունեն հարթ, տրանս, կոնֆիգուրացիա և ենթարկվում են շատ փոքր պտույտի կամ պտտվում են ամիդային կապի շուրջ, որը կապում է մեկ ամինաթթվի α-ամինաթթվի ազոտը կարբոնիլ ածխածնի հետ: հաջորդի (Նկար 4-1).
Ինչու է պեպտիդային կապի շուրջ ռոտացիան արգելված:
Ինչու է պեպտիդային կապի շուրջ ռոտացիան արգելված, և որո՞նք են ռոտացիայի բացակայությունը: Պեպտիդային կապն ունի մասնակի կրկնակի կապի նշան, որը կանխում է ռոտացիան: Պտտման այս բացակայությունը սահմանափակում է պեպտիդային ողնաշարի կոնֆորմացիաները և սահմանափակում հնարավոր կառուցվածքները:
Կարո՞ղ են պեպտիդային կապերը թեքվել:
Քանի որ պոլիպեպտիդի ողնաշարը, որը պահվում է պեպտիդային կապերով, ճկուն է («բոլոր այդ կապերի շուրջ պտույտի» պատճառով), շղթան կարող է թեքվել, ոլորվել, և ճկեք եռաչափ ձևերի շատ մեծ բազմազանության մեջ:
Արդյո՞ք պեպտիդային կապերը շրջելի են:
Թեև պեպտիդային կապի ձևավորումը կարող է հակադարձվել ջրի ավելացման միջոցով (հիդրոլիզ), ամիդային կապերը շատ կայուն են ջրի մեջ չեզոք pH-ով, և պեպտիդային կապերի հիդրոլիզը բջիջներում: վերահսկվում է նաև ֆերմենտային ճանապարհով։
Պեպտիդային կապերն ունե՞ն ուղղություն:
Թեև պեպտիդային խմբի երկրաչափությունը ֆիքսված է, ալֆա ածխածինների երկու կողմերում կապերը կարող են պտտվել: Սա թույլ է տալիս ճկունություն պեպտիդային ողնաշարում: … Սպիտակուցի ամինաթթուների հաջորդականությունը ունի ուղղություն կամ կողմնորոշում, որը սահմանվում է շղթայի ծայրերում գտնվող ֆունկցիոնալ խմբերով:
