BLAST-ը կարող է օգտագործվել մի քանի նպատակների համար: Դրանք ներառում են տեսակների նույնականացում, տիրույթների տեղորոշում, ֆիլոգենիայի հաստատում, ԴՆԹ քարտեզագրում և համեմատություն: BLAST-ի կիրառմամբ դուք կարող եք ճիշտ նույնականացնել տեսակը կամ գտնել հոմոլոգ տեսակներ:
Ինչի՞ համար են օգտագործվում BLAST-ը:
BLAST-ը համակարգչային ալգորիթմ է, որը հասանելի է առցանց օգտագործման համար Կենսատեխնոլոգիայի տեղեկատվության ազգային կենտրոնի (NCBI) կայքում, ինչպես նաև բազմաթիվ այլ կայքերում: BLAST-ը կարող է արագորեն հավասարեցնել և համեմատել հարցումների ԴՆԹ-ի հաջորդականությունըհաջորդականությունների տվյալների բազայի հետ, ինչը այն դարձնում է կարևոր գործիք գենոմային ընթացող հետազոտություններում::
Ի՞նչ է BLAST տեխնիկան:
BLAST տեխնիկան բողոքների լուծման մեթոդ է, որը մշակվել է Ալբերտ Բարնետոյի կողմից : Մնեմոնիկը նշանակում է «Հավատացեք, լսեք, ներողություն խնդրեք, բավարարեք և շնորհակալություն» (Աղյուսակ 1): 6. Այս հոդվածը նկարագրում է դրա օգտակարությունը հիվանդների խնամքի և որպես կլինիկական ուսուցման գործիք:
Ինչպե՞ս է BLAST-ն աշխատում ԴՆԹ-ում:
Ինչպե՞ս է աշխատում BLAST-ը: BLAST նույնականացնում է հոմոլոգ հաջորդականությունը՝ օգտագործելով էվրիստիկ մեթոդը, որն ի սկզբանե գտնում է կարճ համընկնումներ երկու հաջորդականությունների միջև; Այսպիսով, մեթոդը հաշվի չի առնում ամբողջ հաջորդական տարածքը: Սկզբնական համընկնումից հետո BLAST-ը փորձում է սկսել լոկալ հավասարեցումները այս սկզբնական համընկնումներից:
Ինչու՞ է BLAST-ն ավելի արագ, քան Fasta-ն:
Ալգորիթմի գործարկման ժամանակի բարդության առումով BLAST-ն ավելի արագ է, քան FASTA որոնելով միայն ավելի կարևոր օրինաչափություններհաջորդականություն: BLAST-ի և FASTA-ի զգայունությունը (կամ ճշգրտությունը) հակված է տարբեր լինել նուկլեինաթթուների և սպիտակուցների հաջորդականությունների համար (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml):
