Ե՞րբ օգտագործել հոմոոլոգիան:

Բովանդակություն:

Ե՞րբ օգտագործել հոմոոլոգիան:
Ե՞րբ օգտագործել հոմոոլոգիան:
Anonim

Հոմոլոգիայի մոդելները կարող են օգտագործվել նաև ՝ բացահայտելու համար հարակից սպիտակուցների միջև նուրբ տարբերությունները, որոնք ոչ բոլորն են կառուցվածքայինորեն լուծված : Օրինակ, մեթոդը օգտագործվել է Na+/K+ ATPազայի վրա կատիոնների կապակցման վայրերը հայտնաբերելու և տարբեր ATPազերի կապակցման մերձեցման վերաբերյալ վարկածներ առաջարկելու համար:.

Ինչի՞ համար են օգտագործվում հոմոլոգիայի մոդելները:

Հոմոլոգիայի մոդելավորումը հաշվողական կառուցվածքի կանխատեսման մեթոդներից մեկն է, որը օգտագործվում է սպիտակուցի 3D կառուցվածքը որոշելու համար իր ամինաթթուների հաջորդականությունից: Համարվում է, որ այն հաշվողական կառուցվածքի կանխատեսման մեթոդներից ամենաճշգրիտն է։ Այն բաղկացած է բազմաթիվ քայլերից, որոնք պարզ են և հեշտ կիրառելի:

Ի՞նչ է հոմոլոգիայի մոդելավորումը և ինչո՞ւ է այն անհրաժեշտ:

Հոմոլոգիայի մոդելավորումը ստանում է թիրախային սպիտակուցի եռաչափ կառուցվածքը՝ հիմնված կաղապարի և թիրախային հաջորդականությունների նմանության վրա, և այս տեխնիկան ապացուցում է, որ արդյունավետ է, երբ խոսքը վերաբերում է թաղանթային սպիտակուցների ուսումնասիրությանը, դժվար է բյուրեղացնել, ինչպես GPCR, քանի որ այն ապահովում է …-ի ըմբռնման ավելի բարձր աստիճան

Ինչպե՞ս եք անում հոմոոլոգիայի մոդելը:

հոմոլոգիայի մոդելավորման մեջ մի քանի քայլեր կան:

  1. կաղապարի ընտրություն՝ օգտագործելով ձեր թիրախային հաջորդականությունը: Այս նպատակով դուք կարող եք կատարել BLASTp որոնում բոլոր հասանելի սպիտակուցային կառուցվածքների (PDBs) նկատմամբ: …
  2. Կաղապարի և թիրախային հաջորդականության հավասարեցում: …
  3. Ձեր մոդելի որակը։ …
  4. Զարգացումհամապատասխանաբար ձեր մոդելը։

Ի՞նչն է լավ հոմոոլոգիայի մոդելավորումը:

Եթե մենք սահմանում ենք «բարձր հաջողված հոմոոլոգիայի մոդել» որպես էմպիրիկ կառուցվածքից <=2 Å rmsd, ապա կաղապարը պետք է ունենա >=60% հաջորդականության նույնականացում թիրախի հետ հաջողության համար: տոկոսադրույքը >70%: Նույնիսկ բարձր հաջորդականության նույնականացման դեպքում (60%-95%), տասը հոմոոլոգիայի մոդելներից մեկն ունի rmsd >5 Å ընդդեմ

Խորհուրդ ենք տալիս:

Հետաքրքիր հոդվածներ
Կփակվե՞ն port everglades-ը:
Կարդալ ավելին

Կփակվե՞ն port everglades-ը:

Port Everglades-ը ծովային նավահանգիստ է Ֆլորիդա նահանգի Ֆորտ Լոդերդեյլ քաղաքում, որը գտնվում է Բրովարդ կոմսությունում։ Պորտ Էվերգլեյդսը Հարավային Ֆլորիդայի ամենաառաջնային տնտեսական շարժիչներից մեկն է, քանի որ այն հանդիսանում է ինչպես միջազգային առևտրի, այնպես էլ նավարկության հանգստի դարպաս:

Ե՞րբ է Թորի Հոլթը թոշակի անցել:
Կարդալ ավելին

Ե՞րբ է Թորի Հոլթը թոշակի անցել:

Թորի Ջաբար Հոլտը նախկին պրոֆեսիոնալ ամերիկացի ֆուտբոլիստ է, ով տասնմեկ սեզոնների ընթացքում լայնորեն ընդունող էր Ազգային ֆուտբոլային լիգայում: Նա յոթ անգամ հայտնվեց Pro Bowl-ում և անցավ թոշակի՝ ունենալով 10-րդ ամենաշատ ստացվող յարդերը, ներառյալ ռեկորդային վեց անընդմեջ սեզոններ 1,300 յարդերով:

Օսմոզո՞վ, թե՞ դիֆուզիոնով:
Կարդալ ավելին

Օսմոզո՞վ, թե՞ դիֆուզիոնով:

Երբ մարդիկ կենսաբանության մեջ քննարկում են օսմոզը, այն միշտ վերաբերում է ջրի շարժմանը: … Օսմոզի և դիֆուզիայի-ի միջև մեծ տարբերությունն այն է, որ և՛ լուծիչի, և՛ լուծվող նյութի մասնիկները ազատ են շարժվում դիֆուզիայի մեջ, բայց երբ մենք խոսում ենք օսմոսի մասին, միայն լուծիչի մոլեկուլները (ջրի մոլեկուլները) անցնում են թաղանթով: