Պրոլինը հաճախ հանդիպում է α պարույրի վերջում կամ հերթափոխով կամ օղակներով: Ի տարբերություն այլ ամինաթթուների, որոնք գոյություն ունեն գրեթե բացառապես պոլիպեպտիդներում փոխակերպման մեջ, պրոլինը կարող է գոյություն ունենալ պեպտիդների մեջ ցիս-կոնֆիգուրացիայի մեջ:
Ալֆա պարույրները պարունակում են պրոլինի մնացորդներ:
Այժմ, երբ Protein Data Bank-ում կա ավելի քան 30,000 սպիտակուցային կառուցվածք, պարզ է, որ պրոլինի մնացորդները առկա են α-պարույրներում, որտեղ դրանք հաճախ կարևոր դեր են խաղում: սպիտակուցի կառուցվածքի և ֆունկցիայի մեջ։
Ի՞նչ ամինաթթուներ կան ալֆա պարույրներում:
20 ամինաթթուներից որևէ մեկը կարող է մասնակցել α-խխունջին, բայց որոշներն ավելի նախընտրելի են, քան մյուսները: Ala, Glu, Leu և Met ամենից հաճախ հայտնաբերվում են խխունջներում, մինչդեռ Gly, Tyr, Ser և Pro ավելի քիչ հավանական է տեսնել:
Բետա թերթիկները պարունակում են պրոլին?
Պրոլինը նախընտրելի չէ բետա թերթերի կառուցվածքներում, քանի որ այն չի կարող լրացնել H-կապող ցանցը: Երբ պրոլինը հայտնվում է թիթեղներում, այն կարող է լինել ուռուցիկության կամ թաղանթի եզրում, որտեղ ամինաջրածնային կապի դոնորի բացակայությունը կարևոր չէ:
Ի՞նչ է պարունակում ալֆա պարույրներ:
Ալֆա պարույրը (α-խխունջ) ընդհանուր մոտիվ է սպիտակուցների երկրորդական կառուցվածքում և հանդիսանում է աջ ձեռքի պարույրի ձևավորում, որտեղ N−H խմբի բոլոր ողնաշարի ջրածինը կապում է ողնաշարին C=O: ամինաթթուների խումբ, որը գտնվում է չորս մնացորդով ավելի վաղ սպիտակուցի հաջորդականության երկայնքով:
