Արաբինոզը հինգ ածխածնային շաքար է, որը լայնորեն հանդիպում է բնության մեջ և կարող է ծառայել որպես ածխածնի միակ աղբյուր բազմաթիվ բակտերիաների համար: Երեք գեներից (araB, araA և araD) սպիտակուցային արտադրանքներն անհրաժեշտ են Enterobacteriaceae ընտանիքի անդամներին արաբինոզի քայքայման համար, ինչպիսիք են E. coli-ն և S.:
Ի՞նչ է անում արաբինոզը բակտերիաների հետ:
Այսպիսով, երբ արաբինոզա առկա է արաբինոզային օպերոնը միացնելու համար, GFP-ն է արտադրվում, և բակտերիաները կարող են ֆլյուորեսցվել: Առանց արաբինոզայի, GFP գենը չի արտահայտվում և չկա ֆլյուորեսցենտ: Այսպիսով, սննդանյութերի բաղադրությունը փոխելով, հետազոտողը կարող է վերահսկել, թե երբ (և եթե) ծաղկում է առաջանում փոխակերպված բակտերիաներում:
Ի՞նչ դեր ունի արաբինոզը բակտերիաների փոխակերպման մեջ:
Արաբինոզը գործում է որպես AraC-ի ալոստերիկ կարգավորիչ՝ փոխելով ԴՆԹ-ի որ տեղամասերին այն կապվում և ինչպես է ձևավորում դիմեր: Հիշեք, որ արաբինոզը շաքար է, որը կատաբոլիզացվում է AraBAD օպերոնի սպիտակուցներով: Երբ արաբինոզը ավելացվում է այն միջավայրին, որտեղ ապրում է E. coli, այն սերտորեն կապվում է AraC-ի հետ:
Ինչու է օգտագործվում arabinose?
Օգտագործումը կենսաբանության մեջ
Սինթետիկ կենսաբանության մեջ արաբինոզը հաճախ օգտագործվում է որպես միակողմանի կամ շրջելի անջատիչ սպիտակուցի արտահայտման համար Pվատխթանող E. coli-ում: Այս միացված անջատիչը կարող է չեղարկվել գլյուկոզայի առկայությամբ կամ շրջվել՝ մշակման միջավայրում գլյուկոզայի ավելացմամբ, որը կատաբոլիտի ռեպրեսիայի ձև է:
ԻնչպեսԱրաբինոզը ազդում է բակտերիաների գեների կարգավորման և արտահայտման վրա:
Երբ առկա է արաբինոզա, araC-ը թուլացնում է ԴՆԹ-ի կոնֆիգուրացիան, այնպես որ կարող է տեղի ունենալ տրանսկրիպցիա, բայց երբ այս ածխաջրը բացակայում է, նույն սպիտակուցը սահմանափակում է ԴՆԹ-ն՝ նվազեցնելու դրա կապվելու ունակությունը: ՌՆԹ պոլիմերազով։
